人乳腺癌中天然免疫模式識(shí)別受體表達(dá)圖式的研究.pdf

1、癌癥現(xiàn)已成為世界性的公共健康難題，是人類健康的第二大威脅。在女性中，乳腺癌已成為發(fā)病率和致死率高居第一、二位的癌癥。越來越多的研究集中于試圖理清免疫系統(tǒng)的擾亂與癌變之間的相關(guān)關(guān)系。
　　模式識(shí)別受體（Pattern Recognition Receptors,PRRs）是免疫系統(tǒng)的基本組成部分，是由天然免疫細(xì)胞表達(dá)的可以識(shí)別病原相關(guān)分子模式（PAMPs）和損傷相關(guān)分子模式（DAMPs）的蛋白。一部分模式識(shí)別受體表達(dá)在細(xì)胞膜上，比如

2、TLRs（Toll-like receptors），另有一部分模式識(shí)別受體表達(dá)于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)，如RLRs（RIG-like receptors）和NLRs（NOD-like receptors）。越來越多的證據(jù)表明，乳腺癌的發(fā)生發(fā)展可能與天然免疫識(shí)別受體有著一定的聯(lián)系。
　　在本項(xiàng)研究中，我們從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)（The Cancer Genome Atlas）中獲取1215例乳腺癌患者的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)，以分析在不同樣本類型、不同

3、腫瘤分級(jí)，不同腫瘤時(shí)期和TP53突變型中天然免疫受體表達(dá)圖式。同時(shí)我們按照天然免疫模式識(shí)別受體相對(duì)表達(dá)量將病人分為高（50％）、低（50%）表達(dá)的兩組，進(jìn)行總生存期分析，以觀察天然免疫受體表達(dá)量對(duì)于癌癥病人生存期的影響。Kaplan-Meier方法被用于檢查兩組之間的差別。最后選取了TLRs、RLRs以及NLRs信號(hào)通路下游相關(guān)的9種細(xì)胞因子分析其在不同樣本類型、不同腫瘤分級(jí)的樣本中天然免疫受體表達(dá)模式，試圖通過信息學(xué)分析建立細(xì)胞因子表

4、達(dá)量變化與模式識(shí)別受體表達(dá)之間的相互聯(lián)系。
　　我們發(fā)現(xiàn)，在乳腺癌中天然免疫受體基因有三種表達(dá)模式。TLRs及部分NLRs的表達(dá)，NLRP1、NLRP3、NLRP10、NLRX1、NOD1普遍表現(xiàn)出腫瘤組織中的表達(dá)低于正常組織；所有的RLRs的表達(dá)及部分NLRs，NLRP7、NLRP12、NOD2表達(dá)量相對(duì)正常組織都有明顯的表達(dá)升高；也有部分TLRs和NLRs的表達(dá)在正常組織與癌癥組織的表達(dá)之間不存在明顯的表達(dá)差異。同時(shí)我們經(jīng)過分

5、析也觀察到，在其他某些不同來源的數(shù)據(jù)庫(kù)中，有個(gè)別TLR及NLR的表達(dá)模式有所不同，或沒有明顯差異或癌癥組織中表達(dá)水平較高，考慮到各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)來源存在差異或樣本數(shù)量及樣本人群有所不同可能導(dǎo)致這樣的結(jié)果，我們將對(duì)這種現(xiàn)象進(jìn)行進(jìn)一步的研究。
　　對(duì)于不同PAM50亞型，將Lum A/B乳腺癌人數(shù)作為參照比較高表達(dá)和低表達(dá)的人數(shù)發(fā)現(xiàn)，TLR3、TLR6、TLR8、TLR9、RLR3、NLRP6、NLRC5、NOD1、NAIP的高表達(dá)組

6、和低表達(dá)組表現(xiàn)出了明顯的人數(shù)差異，這表明，表達(dá)量的差異與不同亞型之間有一定的相關(guān)性。同時(shí)我們還發(fā)現(xiàn)，在TLRs的分析中，對(duì)于治療難度和惡性程度逐次增加的Lum A/B型、HER2-Enriched型和TNBC（三陰性乳腺癌）型來講，TLR3和TLR4的表達(dá)隨惡性程度的增加而降低，表現(xiàn)出了明顯的相關(guān)性。雖然TLRs在癌癥組織中表達(dá)普遍降低，但有些TLRs的表達(dá)卻并不遵循表達(dá)量越低惡性程度越高這樣的規(guī)律，比如，TLR1和TLR2反而在三陰性

7、乳腺癌中表達(dá)量與正常組織沒有明顯差異，TLR6、TLR7整體比較與正常組織沒有明顯差異，但在TNBC組中表現(xiàn)出了明顯的上調(diào)。對(duì)于RLRs， RLR2的上調(diào)程度伴隨著明顯的惡性程度的加深。RLR3的在Lum A/B型乳腺癌中的表達(dá)明顯高于ER-/PR-型乳腺癌及正常組織。
　　當(dāng)出現(xiàn)TP53突變的時(shí)候我們一般認(rèn)為帶有TP53突變的乳腺癌惡性程度更高，通過分析我們發(fā)現(xiàn)，TLR1、TLR2、TLR6、TLR8、TLR9、RLR2、NLR

8、P7、NLRP10、NLRC4、NLRC5、NOD1、NOD2的表達(dá)量在突變組中明顯高于野生型組，而TLR3、TLR5、RLR3、NLRP6、NLRP12、NAIP的表達(dá)低于野生型組。
　　對(duì)表達(dá)量高低不同的兩組進(jìn)行生存分析后發(fā)現(xiàn)，TLR4、TLR7、NLRP4、NLRP7的表達(dá)高低對(duì)病人的生存期有著明顯的影響，更高的TLR4/TLR7的表達(dá)意味著更差的預(yù)后，而NLRP4/NLRP7卻與此相反，更高的表達(dá)意味著更長(zhǎng)的生存期更好的預(yù)

9、后。其余的PRRs沒有計(jì)算得到明顯的表達(dá)量與預(yù)后之間的明顯關(guān)系。
　　通過對(duì)三類主要的天然免疫模式識(shí)別受體表達(dá)模式以及表達(dá)量與惡性程度的研究我們發(fā)現(xiàn)，對(duì)于選定的這26種模式識(shí)別受體，大多在腫瘤組織、不同PAM50分型、不同臨床分級(jí)、TP53狀態(tài)不同的樣本中有著不同的表達(dá)圖式，而這種上調(diào)或者下調(diào)的表達(dá)對(duì)于乳腺癌的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后有著有所不同卻又重要的影響作用。TLR3、TLR9、RLR2、NLRP6、NLRP7、NOD2的表達(dá)圖式與乳