基于信噪比的蛋白質相互作用的預測研究.pdf

1、蛋白質是生物體中最重要的功能分子。蛋白質間的相互作用構成生命活動的基礎，了解蛋白質間的相互作用可以使我們更深刻地理解生命活動的機理。 傳統(tǒng)上，生命科學的研究是以實驗為基礎的。但是，生物學實驗技術的快速發(fā)展，產(chǎn)生了海量的實驗數(shù)據(jù)，而計算機計算能力的提高，則為生物學數(shù)據(jù)的高速處理提供了嶄新的研究平臺，這一切都有力地推動了生物信息學研究的進一步發(fā)展。如何高效地挖掘出隱藏在這些數(shù)據(jù)中的信息，是現(xiàn)今生物信息學中一個十分熱點的問題。雖然，

2、所有與生命科學有關的理論或結果，都必須回到實驗室進行驗證，但相比于實驗，在計算機上分析數(shù)據(jù)或者實驗模擬，可以大量地節(jié)省人力、物力以及時間，來獲取信息，進一步提高生命科學研究的效率。 目前已經(jīng)有了很多的現(xiàn)有數(shù)學工具可以用到蛋白質相互作用研究的問題上，如，支持向量機、隱馬氏模型、神經(jīng)網(wǎng)絡、小波變換等。 蛋白質的一級結構可以簡單地認為是一字符序列，將里面的字符賦予與之對應的數(shù)值后可以認為這是一個蛋白質信號。在共鳴識別模型中

3、，分析蛋白質信號，得到相互作用蛋白質的特性。再加入離散小波變換的改進共鳴識別模型利用這個特性直接來分析和預測蛋白質間的相互作用。 不同物種的蛋白質有不同特性，從而有必要引入不同的判別參數(shù)來分析不同種類蛋白質內的相互作用。本文中，大量地引入酵母陽性蛋白質相互作用對經(jīng)分析，發(fā)現(xiàn)改用信噪比作為判別參數(shù)后，預測的效率得到了提高。為了說明這個方法在改用信噪比后的有效性，我們使用大量的隨機數(shù)據(jù)與陽性數(shù)據(jù)進行比對，提出比對準則，得到了兩類數(shù)