中國8個(gè)黃牛品種線粒體DNA遺傳多樣性研究.pdf

1、　　本研究從我國山東省、四川省、海南省、廣東省、福建省、江西省及黑龍江省采集魯西牛(SJ)、渤海黑牛(SW)、宣漢牛(XH)、海南黃牛(HN)、徐聞黃牛(LZ)、閩南牛(MN)、贛南黃牛(T)與延邊牛(YB)共8個(gè)品種的33個(gè)樣品，利用PCR技術(shù)，自行設(shè)計(jì)一對特異性引物，用ClustalW(1.82)軟件對8個(gè)黃牛品種33個(gè)個(gè)體的線粒體DNAD-loop區(qū)910bp全序列進(jìn)行同源序列比對與分析，實(shí)驗(yàn)取得如下結(jié)果： 　　1.檢測到中國8

2、個(gè)黃牛品種33個(gè)個(gè)體有21種單倍型；在這21種單倍型D-loop區(qū)全序列中，堿基T平均占28.5﹪，C占24.9﹪，G占13.6﹪，A占33.0﹪。A+T平均含量為61.5﹪，G+C平均含量為38.5﹪，說明中國黃牛D-loop全序列富含A+T堿基。 　　2.檢測到21種單倍型有核苷酸多態(tài)位點(diǎn)71個(gè)，約占所測核苷酸總長的7.80﹪，其中有61個(gè)轉(zhuǎn)換，7個(gè)顛換，3個(gè)轉(zhuǎn)換/顛換共存。 　　3.中國8個(gè)黃牛品種mtDNAD-loop區(qū)核苷

3、酸多樣度(π值)為0.00﹪～3.23﹪，單倍型多樣度(H)為0.00～1.00，8個(gè)黃牛群體D-loop的核苷酸多樣度(π值)分2個(gè)層次，海南牛、徐聞牛、贛南牛及延邊牛的核苷酸多樣度(π值)最低，分別為0、0.22﹪、0.15﹪和0.77﹪；閩南牛、渤海黑牛、魯西牛和宣漢牛的苷酸多樣度(π值)很高，別為2.53﹪、2.88﹪、3.03﹪和3.23﹪。表明中國8個(gè)黃牛品種mtDNA遺傳多樣性比較豐富。 　　4.根據(jù)單倍型構(gòu)建了中國8個(gè)

4、黃牛品種的NJ分子系統(tǒng)樹。聚類表明，中國黃牛有普通牛和瘤牛2大母系起源。延邊牛、渤海黑牛(SW10、SW15)、宣漢牛(XH6、XH9)、魯西牛(SJ8、SJ27)，它們與普通牛(ST)聚在一起，說明它們起源于普通牛；宣漢牛(XH7)、徐聞牛(LZ16)、魯西牛(SJ5、SJ12、SJ19)、贛南黃牛(T11、T23)、海南牛(HN1)、閩南牛(MN4、MN5)，它們與瘤牛(L27732)聚在一起，說明它們起源于瘤牛。 　　5.并探討