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文檔簡(jiǎn)介
1、本文結(jié)合生物遺傳與進(jìn)化的規(guī)律，設(shè)計(jì)了一種訓(xùn)練隱馬爾可夫模型的遺傳算法。根據(jù)基因比對(duì)的需要和HMM的結(jié)構(gòu)，定義了三種遺傳操作和編碼方式。為了檢驗(yàn)算法的有效性，用20個(gè)原核5sRNA和100條水稻mRNA序列作訓(xùn)練集對(duì)模型進(jìn)行訓(xùn)練，然后用訓(xùn)練好的模型再對(duì)訓(xùn)練序列進(jìn)行比對(duì)，并將該算法在Matlab軟件上編程實(shí)現(xiàn)。最后將實(shí)驗(yàn)結(jié)果與用B-W訓(xùn)練HMM進(jìn)行比對(duì)的結(jié)果進(jìn)行了多方面的比較。從比較的結(jié)果看，遺傳訓(xùn)練出的HMM模型對(duì)產(chǎn)生20條序列的概率對(duì)數(shù)
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