鱸鯉免疫相關(guān)基因的克隆及日糧蛋白水平對其表達(dá)量的影響.pdf

1、本試驗對鱸鯉幼魚Defensin、Hepcidin、TNF-α和IL-10等4個免疫相關(guān)基因完整的編碼區(qū)序列進(jìn)行了克隆和分析，并研究不同蛋白水平日糧飼喂鱸鯉幼魚后，4種免疫基因在各組織中表達(dá)模式;另外為篩選穩(wěn)定內(nèi)參基因，探討了常用管家基因EF-1α、B2M、 ODC、β-αctin和GAPDH基因在同等試驗條件下在多種組織表達(dá)穩(wěn)定性。試驗結(jié)果充實和拓展了鱸鯉營養(yǎng)免疫學(xué)研究資料，為鱸鯉健康養(yǎng)殖提供了試驗依據(jù)。
　　試驗采用克隆、測序

2、等基本方法獲得相關(guān)免疫基因序列。采用單因子方案設(shè)計，選擇480尾體質(zhì)健康、平均體重在(15.2±1.1)g鱸鯉幼魚，隨機(jī)分為4組，每組3個重復(fù)，每個重復(fù)40尾，分別飼喂蛋白質(zhì)水平為37.41％(Ⅰ)、40.10％(Ⅱ)、44.34％(Ⅲ)、49.20％(Ⅳ)的試驗日糧。80d試驗期后，每組隨機(jī)挑選6尾魚，采集大腦、腮、頭腎、脾臟、肝臟、后腸、皮膚和心臟等組織，采用熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)檢測樣品中各基因表達(dá)量，并用RefF

3、inder和geNorm軟件分析內(nèi)參基因穩(wěn)定性。結(jié)果表明:
　　1.Hepcidin、TNF-α、Defensin、IL-10基因CDS區(qū)序列:4種基因全長分別為282、711、204、540bp;分別編碼93、236、67、179個氨基酸;信號肽切割位點分別在24～25、50～51、24～25和22～23位間。各基因編碼氨基酸進(jìn)化樹與形態(tài)分類學(xué)地位基本一致，預(yù)測的編碼蛋白質(zhì)分子量分別為10.6kDa、26.4kDa、7.2kDa

4、和20.9kDa;等電點為6.39、5.25、8.22和8.42; Defensin編碼蛋白為疏水性蛋白質(zhì)，其他基因編碼蛋白為親水性蛋白質(zhì)。
　　2.沒有單一穩(wěn)定的內(nèi)參基因可以適用于不同蛋白水平日糧飼喂的各組鱸鯉不同組織中的表達(dá)分析。通過Reffinder分析可知，EF-1α在不同組織間表達(dá)最穩(wěn)定，最適合做單一內(nèi)參基因;在不同組間同一組織中最穩(wěn)定表達(dá)基因不同，肝臟和皮膚中為EF-1α，后腸、脾臟、腮、心臟和頭腎為B2M，大腦為OD

5、C，這些基因適合在相應(yīng)組織中做單一內(nèi)參基因。Genorm分析，所有Vn/Vn+1都小于0.15，說明2個最穩(wěn)定內(nèi)參基因足以滿足在相應(yīng)條件下的定量校正。
　　3.4種基因在各組織中均可檢測到，除TNF-α外且具有組織特異性。Defensin皮膚中表達(dá)量顯著高于其他組織(P＜0.05);Hepcidin在肝臟中表達(dá)最高，其次為脾臟和后腸，不同組織間差異顯著(P＜0.05);IL-10在腮中表達(dá)顯著高于其他各組織(P＜0.05)，其次為

6、脾臟、后腸、頭腎等組織;TNF-α在各組織中表達(dá)差異不顯著(P＞0.05)?？傮w表達(dá)量來看，IL-10和TNF-α在各組織中表達(dá)水平相對較低。
　　4.隨著日糧蛋白水平提高，Defensin在大腦、IL-1在腮和后腸表達(dá)模式相同，表達(dá)水平均呈現(xiàn)先升高后降低趨勢，最高表達(dá)都出現(xiàn)在Ⅱ組，顯著高于其他各組(P＜0.05)，2種基因在其余組織各組間表達(dá)差異不顯著（P＞0.05）;Hepcdin在大腦、肝臟和脾臟中表達(dá)量先增加后降低，均在Ⅲ

7、組達(dá)到最高，其余組織各組間表達(dá)差異不顯著(P＞0.05);TNF-α基因除了心臟中有先升高后下降趨勢外，其他各組織組間差異不顯著(P＜0.05)。
　　研究結(jié)果提示，檢測各組不同組織4種基因表達(dá)時，可考慮EF-1α作單一內(nèi)參基因;檢測4種基因在同一組織中表達(dá)分析時，應(yīng)選用相應(yīng)的適宜內(nèi)參基因，肝臟和皮膚可選EF-1α，后腸、脾臟、腮、心臟和頭腎可選B2M,腦可選ODC。日糧中適宜的蛋白添加水平可以促進(jìn)相關(guān)免疫基因的表達(dá)，當(dāng)添加蛋白量