西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳多樣性分析及其毒性相關(guān)基因分布頻率初步預(yù)測.pdf

1、由稻瘟病菌(Magnapothe oryzae)引起的稻瘟病是世界水稻生產(chǎn)中三大毀滅性病害之一，也是西南地區(qū)一季稻常見的流行性病害之一。該病害在貴州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地發(fā)生率非常高。因此，致力于稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性的研究、掌握其毒性相關(guān)基因的出現(xiàn)頻率，對于品種選育、合理布局和延長抗病品種的使用壽命等方面都具有重要的意義。
　　本研究通過對西南地區(qū)8個縣（市）所采集到的穗頸瘟標(biāo)樣進(jìn)行病菌分離，選用13對SS

2、R引物和16對毒性相關(guān)基因特異性引物對病原菌基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。根據(jù)反應(yīng)的結(jié)果，建立基于SSR序列和毒性相關(guān)基因序列的0-1數(shù)據(jù)庫，通過一系列軟件對病原菌群體遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性進(jìn)行分析，并根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果初步預(yù)測毒性相關(guān)基因的分布頻率，得到如下結(jié)論:
　　1、通過分離得到200個單孢分離菌株。其中四川雅安52株，溫江37株，南充33株，自貢6株;重慶永川25株，墊江24株，梁平15株;貴州湄潭8株。
　　2、8對SSR

3、引物都能擴(kuò)增出特異性條帶，擴(kuò)增頻率較高，大部分在95.00％以上;16對毒性相關(guān)基因特異性引物均能擴(kuò)增出目的條帶，擴(kuò)增頻率差異較大。
　　3、西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)復(fù)雜，層次豐富。200個供試菌株可以歸為90個不同的單元型，包括1個絕對優(yōu)勢單元型，22個次要單元型，67個稀有單元型。在0.90遺傳相似水平下劃分為24個遺傳宗譜，包括1個絕對優(yōu)勢宗譜、5個亞優(yōu)勢宗譜、7個次要宗譜和11個小宗譜。8個區(qū)域稻瘟病菌的單元型和遺傳宗

4、譜都非常豐富。相同來源的菌株能夠構(gòu)成不同的單元型和遺傳宗譜，同一單元型和遺傳宗譜的菌株來源也不盡相同，各區(qū)域內(nèi)的菌株在群體遺傳結(jié)構(gòu)上反映出一定的特異性和明顯的多樣性。
　　4、通過遺傳參數(shù)分析顯示西南地區(qū)稻瘟病菌的遺傳多樣性比較豐富。在群體平均水平上，有效等位基因數(shù)目（Ne）為1.4466，Nei's基因多樣性指數(shù)(H)為0.2753，Shannon信息指數(shù)(I)為0.4291，多態(tài)性位點數(shù)(NP)為28個，多態(tài)位點百分率（P）為

5、96.50％。不同區(qū)域之間，各群體的遺傳多樣性水平具有一定差異。來源于南充的稻瘟病菌群體具有較高的遺傳多樣性，其次是自貢、永川、雅安相對較高，而溫江和墊江相對較低，梁平和湄潭區(qū)域最低。
　　5、西南地區(qū)稻瘟病菌群體存在一定的遺傳分化，群體內(nèi)多樣性大于群體間多樣性，且總遺傳變異的40.14％存在于群體間，59.86％存在于群體內(nèi)（Gst=0.4014）。
　　6、Nei(1972)無偏倚遺傳距離范圍為0.0357～0.6173

6、，遺傳相似度范圍為0.5394～0.9649，8個群體間的平均遺傳距離為0.1901，平均遺傳相似度為0.8383。8個區(qū)域稻瘟病菌群體親緣關(guān)系由近到遠(yuǎn)依次為雅安、南充、墊江、梁平、湄潭、溫江、永川和自貢。
　　7、各致病基因特異性引物在群體間和群體內(nèi)的擴(kuò)增頻率差異都較大，大部分無毒基因特異性引物在群體間和群體內(nèi)的擴(kuò)增頻率差異較大，據(jù)此初步預(yù)測各毒性相關(guān)基因在群體中的分布頻率，為聚合育種、品種布局、延長抗病品種的使用壽命提供一定的