小麥基因組中鈣依賴型蛋白激酶家族的生物信息學(xué)分析.pdf

1、鈣依賴型蛋白激酶（Calcium dependent protein kinase，CDPK）在植物的發(fā)育、激素反應(yīng)、代謝調(diào)節(jié)、逆境脅迫以及防御反應(yīng)等過程中具有廣泛的生理功能。本研究應(yīng)用生物信息學(xué)方法，從數(shù)據(jù)庫中挖掘出與小麥CDPK相關(guān)的序列，通過尋找迭代群或EST拼接確定小麥基因組中編碼CDPK家族的UniGene；將所獲得到的核酸和蛋白質(zhì)序列與近緣物種進(jìn)行比對分析，對CDPK家族進(jìn)行分類；對所獲得的全長CDPK蛋白質(zhì)構(gòu)象和生物學(xué)功能

2、進(jìn)行預(yù)測。通過以上研究，為進(jìn)一步在基因組范圍內(nèi)對小麥CDPK家族的組成、基因克隆和生物功能的研究奠定基礎(chǔ)。 所獲得的主要研究結(jié)果如下： 1、獲得了162條小麥CDPK ESTs的序列信息。 2、通過尋找迭代群或EST拼接，得到了10條UniGene相應(yīng)的全長ORF序列。在氨基酸水平比對相同物種ORF編碼的蛋白質(zhì)序列和近緣物種相似蛋白序列，表明所得UniGene為小麥中未報道的cdpk基因。 3、通過蛋白質(zhì)