甘藍(lán)型油菜“丙409”光周期敏感性QTLs定位及轉(zhuǎn)錄組分析.pdf

1、光周期對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育有著重要的影響，油菜是長(zhǎng)日照植物，尋找具有廣適應(yīng)性的油菜品種，有利于甘藍(lán)型油菜的種質(zhì)資源的創(chuàng)新，提高甘藍(lán)型油菜對(duì)不同播種季節(jié)和地理緯度的適應(yīng)性，對(duì)油菜的遺傳改良和品種選育有著重要的意義。
　　本研究以對(duì)光周期敏感的丙409和對(duì)光周期不敏感的中雙8號(hào)為親本構(gòu)建的包含有150個(gè)株系的DH群體為材料，利用DH群體的遺傳連鎖圖譜，采用復(fù)合區(qū)間作圖法，通過(guò)3年多點(diǎn)的不同光周期試驗(yàn)，對(duì)開花時(shí)間進(jìn)行QTL定位和效應(yīng)分析。同

2、時(shí)在氣候箱里對(duì)親本進(jìn)行不同的光周期處理(16h/8h，12h/12h)，長(zhǎng)到一個(gè)月時(shí)從光照開始的時(shí)間開始取樣，每隔4個(gè)小時(shí)取一次樣，取樣時(shí)間為0h(光照開始時(shí))，4h，8h，12h，16h，20h，24h。取葉片提RNA，兩個(gè)重復(fù)，進(jìn)行RNA-seq，找到控制花期的差異基因。
　　主要研究結(jié)果如下:
　　1.DH群體在6個(gè)環(huán)境下的開花期QTL信息
　　DH群體在4個(gè)地點(diǎn)（武漢，和政，烏魯木齊，韶關(guān)）共6個(gè)環(huán)境（3年*1

3、點(diǎn)+1年*3點(diǎn)）下調(diào)查開花期，共檢測(cè)到11個(gè)與初花期有關(guān)的QTL，其中在6個(gè)環(huán)境中都檢測(cè)到了C8染色體上的同一個(gè)QTL，平均解釋了表型變異的11.31％;在E1，E2，E3，E6環(huán)境下都檢測(cè)到在A3染色體上的同一個(gè)QTL，平均解釋了表型變異的7.89％;在E1，E3，E5，E6環(huán)境下都檢測(cè)到了在A2染色體同一個(gè)QTL，解釋了表型變異的10.32％。只在一個(gè)地點(diǎn)檢測(cè)到QTL有7個(gè)。
　　2.光周期敏感性的分析
　　對(duì)不同地點(diǎn)的

4、開花期做了光周期敏感性分析，共檢測(cè)到11個(gè)和光周期敏感性相關(guān)的位點(diǎn)。其中在E1-E6，E2-E6，E3-E6，E3-E4，E4-E6，E5-E6都檢測(cè)到了在A2染色體上的同一個(gè)QTL位點(diǎn)，平均解釋了表型變異的12.59％;在E1-E6，E2-E5，E2-E6，E3-E6，E4-E5，E4-E6都檢測(cè)到了在C8染色體上的同一個(gè)QTL位點(diǎn)，平均解釋表型變異的17％;在E1-E6，E2-E4，E2-E6環(huán)境下都檢測(cè)到了A3染色體上的QTL位點(diǎn)

5、，平均解釋了表型變異的5.12％。只在兩個(gè)環(huán)境比對(duì)下檢測(cè)到的QTL有5個(gè)。
　　3.甘藍(lán)型油菜在不同光周期下的轉(zhuǎn)錄組分析
　　在相同光周期下的相同時(shí)間點(diǎn)對(duì)丙409和中雙8號(hào)的相對(duì)表達(dá)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)16h光周期條件下24h時(shí)的差異表達(dá)基因最多，為19965個(gè);在12個(gè)小時(shí)光照下T12差異表達(dá)基因最多，為18859個(gè)。比較了丙409和中雙8號(hào)分別在16h與12h光周期相比在相同時(shí)間點(diǎn)DEG的表達(dá)情況，發(fā)現(xiàn)丙409在24h的時(shí)候差