家鵝mtDNA序列結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性分析.pdf

1、該研究采用PCR和DNA測序技術(shù)測定了6個中國家鵝品種和2個歐洲鵝品種25個個體線粒體DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)部分序列,分析了序列的相似性及雁屬鵝種間的遺傳多樣性、2個tRNA基因(tRNA<'Pro> 、tRNA<'Thr>)的二級結(jié)構(gòu)和細(xì)胞色素b(cytochrome b,Cyt b)跨膜螺旋結(jié)構(gòu)及序列的變異特征.結(jié)果表明:得到的家鵝線粒體DNA1401bp序列包括ND5基因部分序列77 bp、細(xì)胞

2、色素b基因全序列1143 bp、tRNA<'Thr>全序列68 bp和tRNA<'Pro>全序列69 bp;線粒體DNA 1401 bp序列與基因庫中白額雁(Anser albifrons)、鉆水鴨(Aythya americana)的序列相似率分別為97﹪、88﹪,灰雁和鴻雁家鵝Cyt b的氨基酸序列與白額雁的相似率分別為99.7﹪和100﹪,表明該次實驗所測序列是真實可靠的;2個tRNA基因三葉草結(jié)構(gòu)的氨基酸臂、反密碼子環(huán)在鴻雁、灰

3、雁和白額雁種間沒有發(fā)生變異;家鵝Cyt b基因的核苷酸序列在膜內(nèi)、膜間和膜外的變異位點數(shù)分別為12、9和10,膜內(nèi)、膜間的變異均屬同義替換,而膜外有兩個位點發(fā)生了非同義替換,表明跨膜螺旋的膜外區(qū)域變異程度高于膜間和膜內(nèi),但膜間親水氨基酸的比例為5.26﹪,遠(yuǎn)小于膜外(鴻雁16.58﹪、灰雁16.31﹪)和膜內(nèi)(17.38﹪);8個家鵝品種25條序列(1401 bp)共檢測到22個變異位點,3種單倍型,單倍型樣度和核苷酸多樣度分別為0.5