瓜類細(xì)菌性果斑病菌種內(nèi)遺傳多樣性的研究.pdf

1、瓜類細(xì)菌性果斑病是發(fā)生在葫蘆科作物上的一種嚴(yán)重的世界性病害，其病原為西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)。該病可侵染多種葫蘆科作物并在世界多國(guó)和我國(guó)多個(gè)省份發(fā)生，給當(dāng)?shù)氐奈魈鸸戏N植業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。
　　 瓜類細(xì)菌性果斑病菌存在豐富的遺傳多樣性，為抗病品種的篩選增加了困難，本論文用脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis，PFGE)和多位點(diǎn)序列分型(Multilocu

2、s Sequence Typing，MLST)兩種方法研究了118株國(guó)內(nèi)外瓜類果斑病菌的種內(nèi)遺傳多樣性，主要獲得以下結(jié)論：
　　 (1)PFGE多態(tài)性電泳圖譜表明118株菌共呈現(xiàn)出19條條帶，大小在200～2000 kb之間，所有菌株歸結(jié)為9種條帶類型。Ntsys2.1分析，所有菌株分為兩個(gè)亞群，亞群1有73個(gè)菌株，其中67株分離自甜瓜；亞群2有45個(gè)菌株，其中42株分離自西瓜。即亞群1主要是分離自甜瓜的菌株，亞群2主要是分離自

3、西瓜的菌株，表明果斑病菌在寄主上存在明顯的遺傳分化。112株中國(guó)菌株中，71株屬于亞群1，其中64株是我國(guó)內(nèi)蒙古和新疆的菌株；41株屬于亞群2，包括我國(guó)多個(gè)省份的菌株，沒有形成優(yōu)勢(shì)地理來源。美國(guó)的典型菌株Fc247和美國(guó)菌株Fc520歸屬于亞群1，其他4株國(guó)外菌株都?xì)w屬于亞群2。PFGE分型技術(shù)結(jié)果容易判斷、重復(fù)性好，獨(dú)具對(duì)大片段DNA分子的分型能力，結(jié)果較準(zhǔn)確。
　　 (2)利用7個(gè)看家基因adk、gltA、glyA、pilT

4、、spi、ugpB、glnA對(duì)果斑病菌進(jìn)行MLST研究表明118個(gè)菌株共形成73個(gè)序列型(sequence type，ST)，程序eBURST V3分析，所有菌株分成了3個(gè)群：亞群1(group1)、亞群2(group2)和1個(gè)單一群(singleton)。亞群1包括53個(gè)ST，共82個(gè)菌株；亞群2包括19個(gè)ST，共35個(gè)菌株。從寄主來看，亞群1的82個(gè)菌株中有甜瓜菌株68株、西瓜菌株14株；亞群2的35個(gè)菌株中有甜瓜菌株2株、西瓜菌株

5、33株；美國(guó)的西瓜菌株Fc380成為1個(gè)單一群(singleton)。該結(jié)論與PFGE結(jié)果比較吻合，即亞群1主要是分離自甜瓜的菌株，亞群2主要是分離自西瓜的菌株。不同的是，北京的10個(gè)西瓜菌株分在了亞群1，可能說明這10個(gè)菌株與甜瓜菌株的親緣關(guān)系較近。從地理來源看，亞群1的核心型ST45包括3個(gè)菌株，都來自我國(guó)新疆，推測(cè)亞群1的其他菌株與新疆的菌株關(guān)系更密切。亞群2的核心型ST5包括11個(gè)菌株，來自我國(guó)北京、新疆、海南、黑龍江和臺(tái)灣，可