應(yīng)用SNP標(biāo)記區(qū)分云南瑞麗野生枸櫞個(gè)體和柚SNP標(biāo)記開發(fā)初探.pdf

1、柑橘有4000多年的悠久栽培歷史，而且種屬間較易雜交、芽變頻率較高，親緣關(guān)系復(fù)雜，致使人們難以對(duì)其進(jìn)行分類研究，已有的幾個(gè)系統(tǒng)至今仍頗具爭議。DNA分子標(biāo)記為研究柑橘分類和品種鑒別問題提供了新的手段。其中，單核苷酸多態(tài)性(SNP)在基因組中發(fā)生頻率較高、穩(wěn)定性好，可供人們進(jìn)行規(guī)?；治?。對(duì)柑橘屬植物進(jìn)行SNP分析，可以深入評(píng)價(jià)該屬植物的遺傳多態(tài)性，有助于理清柑橘種屬間的分類進(jìn)化關(guān)系，有利于構(gòu)建高密度遺傳圖譜、分析特定基因的功能以及進(jìn)行分

2、子標(biāo)記輔助育種等。本研究利用SNP標(biāo)記分析了云南瑞麗野生枸櫞和柚的遺傳多樣性。結(jié)果如下：
　　 ⑴云南瑞麗野生枸櫞的遺傳多樣性研究。以地理分布上分屬3個(gè)地方居群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)的15個(gè)采自云南瑞麗的野生枸櫞個(gè)體為材料，利用PCR-SSCP技術(shù)篩選分析SNP標(biāo)記，共從102對(duì)引物中篩選出了PCR產(chǎn)物多態(tài)性豐富的15對(duì)引物，并根據(jù)PCR產(chǎn)物譜帶多態(tài)性進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明：1)這些野生枸櫞個(gè)體依據(jù)SNP多態(tài)性可分為3個(gè)大的類群

3、，Ⅱ5單獨(dú)為一類，Ⅱ1、Ⅱ2、Ⅱ6和Ⅲ1、Ⅲ2、Ⅲ5、Ⅲ6可聚為一類，其它樣品為另一類，分子標(biāo)記結(jié)果與地理分布無明顯的相關(guān)性，表明地理隔離所造成的遺傳漂變尚不明顯，所有的個(gè)體應(yīng)屬于同一繁育居群。2)只需憑借少數(shù)SNP組合就可以區(qū)分所有的個(gè)體，說明SNP標(biāo)記在區(qū)分野生枸櫞個(gè)體上很有價(jià)值。
　　 ⑵柚種質(zhì)資源的遺傳多樣性研究。用PCR-SSCP技術(shù)篩選了適合柚品種SNP多態(tài)性研究的引物。同時(shí)根據(jù)等位基因(單體型)來設(shè)計(jì)特異性PCR引