提燈蘚科DNA條形碼的篩選.pdf

1、DevelopmentofDNABarcodesforM●nlaCeaeThe“submittedt011eslssUbinlttetoQngdaoAgriculturalUniversityInFulfillmentoftheRequirementfortheDegreeof—MasterofScienceWUshaozhen(DepartmentofScience)3UperVlS0r：Y1VanlU玨d●l7●●lvvQingda

2、o。ChinaJune，2013青島農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要提燈蘚科(Mniaceae)DNA條形碼的篩選摘要DNA條形碼是加拿大動(dòng)物學(xué)家PaulHebert于2003年首次提出的，是指利用一個(gè)或幾個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的、相對(duì)較短的DNA片段(DNAbarcode)對(duì)地球上的物種進(jìn)行快速鑒定的新技術(shù)。該技術(shù)與經(jīng)典分類(lèi)學(xué)的物種鑒定相比，準(zhǔn)確性高、效率高、不受被鑒定對(duì)象的環(huán)境、個(gè)體發(fā)育和鑒定專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn)的影響等優(yōu)點(diǎn)，因此在物種鑒定方面具有廣闊的應(yīng)用前景。提燈

3、蘚科植物是苔蘚植物中較大的一個(gè)類(lèi)群，在我國(guó)南北各地均有分布，尤其是山嶺地區(qū)常見(jiàn)的蘚類(lèi)植物。世界已報(bào)道的先后有12屬約100余種，主要分布在北半球溫帶地區(qū)，尤以東亞種類(lèi)最多，在我國(guó)南北各地都很習(xí)見(jiàn)。十九世紀(jì)后期以來(lái)，有不少中夕卜植物學(xué)工作者對(duì)我國(guó)提燈蘚科植物進(jìn)行采集和研究，目前記錄有8屬50種植物。對(duì)于提燈蘚科植物DNA條形碼的研究還鮮有報(bào)道。本文選取苔蘚植物標(biāo)本91份，涵蓋提燈蘚科4屬20余種，利用核基因1TS2序列以及葉綠體基因序列t

4、rnHpsbAtrnLtrnF，rps4和trnG探究了其在提燈蘚科植物中的鑒定情況，獲得的結(jié)果如下：1綜合barcodinggap檢測(cè)結(jié)果和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析結(jié)果，trnHpsbA、trnL一咖Frps4、trnG和1TS2序列中，rps4trnG和ITS2序列的鑒定能力較好，trnLtrnF和trnHpsbA序列不能單獨(dú)用于提燈蘚科植物鑒定。2綜合barcodinggap檢測(cè)結(jié)果和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析結(jié)果，trnL—trnF和trnG序列

5、組合以及rps4和trnG序列組合的鑒定結(jié)果更準(zhǔn)確，可以用于提燈蘚科植物的鑒定。trnHpsbA和rps4序列組合、trnLtrnF和rps4序列組合以及trnHpsbA和trnG的序列組合的鑒定結(jié)果相對(duì)差一些，但是可以作為參考。trnHpsbA和trnLtrnⅣ序列組合不能用于提燈蘚科植物的鑒定。3在所有進(jìn)化分析中，匐燈蘚(Plagiomniumcuspidatum)和尖葉匐燈蘚(Plagiomniumacutum)始終以很高的支持率

6、聚在一起。通過(guò)Blast比對(duì)，與GenBank中登錄的匐燈蘚或尖葉匐燈蘚的序列非常近似。我們?cè)谶M(jìn)行標(biāo)本的鑒定過(guò)程中，確實(shí)發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)種極為相似，單單通過(guò)外形很難區(qū)分。一直以來(lái)，尖葉匐燈蘚作為匐燈蘚的亞種或變種處理。Koponen認(rèn)為尖葉匐燈蘚應(yīng)該作為一個(gè)單獨(dú)的種，因?yàn)槠涫谴菩郛愔甑?，有別于匐燈蘚的雌雄同株。但是我們的分子證據(jù)表明，這兩者的序列是極其相似的，以至于自始至終它們都聚于一支；因此，我們認(rèn)為應(yīng)該將這兩者合并，尖葉匐燈蘚作為匐燈蘚的