白氏文昌魚IKK基因的克隆及其免疫功能分析.pdf

1、形態(tài)學(xué)以及分子生物學(xué)的證據(jù)表明文昌魚是脊索動物中的基底生物，是研究脊椎動物形態(tài)、發(fā)育以及免疫系統(tǒng)的起源與進(jìn)化的重要模式生物。隨著比較免疫學(xué)的迅速發(fā)展，以及佛羅里達(dá)文昌魚基因組測序的完成，關(guān)于文昌魚免疫的研究越來越引起人們的關(guān)注。因此，本研究在文昌魚EST數(shù)據(jù)庫的基礎(chǔ)上，利用分子生物學(xué)方法初步研究了文昌魚IKK基因在LPS刺激后的免疫應(yīng)答方面的機(jī)制，同時結(jié)合進(jìn)化分析了文昌魚IKK基因在進(jìn)化中的地位，本論文主要的研究成果如下:
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2、1)利用RACE對白氏文昌魚的AmphilKK基因進(jìn)行克隆，結(jié)果表明AmphiIKK基因的cDNA序列全長3087bp，其中ORF包含2334bp，預(yù)計編碼777aa，5'UTR包含164bp，3'UTR包含589bp。
　　(2)經(jīng)過初步分析表明，AmphiIKK的理論分子量為89.3kDa，等電點(diǎn)為6.26;AmphilKK與之前發(fā)現(xiàn)的IKK蛋白之間存在著43.8％-64.0％的相似性，23.6％-43.3％的一致性。Amph

3、ilKK蛋白具有哺乳動物IKK蛋白一樣，具有一個保守的絲氨酸/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域，在這個結(jié)構(gòu)域中，含有一個絲氨酸/蘇氨酸激酶活化位點(diǎn)和一個保守的MAPKK活化莖環(huán)。與人類的IKKα和IKKβ比較，文昌魚IKK蛋白同樣具有一個潛在的HLH基序，一個LZ結(jié)構(gòu)，和NBD結(jié)構(gòu)。AmphilKK蛋白的空間三級結(jié)構(gòu)與其他7個物種的IKK蛋白均相同，均折疊成“手槍”狀。系統(tǒng)發(fā)育分析表明，AmphilKK間于無脊椎動物和脊椎動物之間，和合浦珠母貝、太平洋