紫菜核糖體rDNA基因結(jié)構(gòu)多樣性分析.pdf

1、紫菜是我國重要的海洋經(jīng)濟作物,是潮間帶藻類的模式物種。生活史包括大型配子體(葉狀體)世代和微型孢子體(絲狀體)世代,繁殖方式包括無性繁殖和有性繁殖兩種,這種特殊而又復(fù)雜的生活史使得紫菜在進化過程中具有較高的變異度。
　　核糖體rDNA基因作為一種分子標(biāo)記用于研究種的分類及遺傳多樣性被廣泛接受,但最近研究發(fā)現(xiàn)許多真核生物的rDNA基因結(jié)構(gòu)在種間及種內(nèi)存在變異,甚至在個體內(nèi)部ITS序列也存在多樣性。這種變異及多態(tài)性對于正確解釋物種的系

2、統(tǒng)發(fā)生和遺傳結(jié)構(gòu)顯得尤為重要。本研究以條斑紫菜和壇紫菜為研究對象,對兩個物種野生群體和養(yǎng)殖群體的核糖體rDNA在基因結(jié)構(gòu)的多樣性進行了分析,取得以下結(jié)果:
　　1.條斑紫菜養(yǎng)殖群體30個個體和野生群體27株個體的18SrDNA均不包含內(nèi)含子序列,ITS序列未呈現(xiàn)明顯的插入/缺失,EcoRV帶型沒有呈現(xiàn)多樣性,表明所選用的來自不同品系的個體間及個體內(nèi)18SrDNA-ITS-5.8SrDNA基因結(jié)構(gòu)單一。其二級結(jié)構(gòu)能使18SrRNA的

3、3'端、5.8SrRNA、28SrRNA5'端,三部分成熟端互相靠近,形成一個核心結(jié)構(gòu)。
　　2.壇紫菜野生群體18SrDNA-ITS-5.8SrDNA在不同個體間及個體內(nèi)呈現(xiàn)多態(tài)性,EcoRV帶型亦呈現(xiàn)多態(tài),測序分析發(fā)現(xiàn),部分個體18SrDNA含有I型內(nèi)含子結(jié)構(gòu),大小為554bp,插入位點為18SrDNA的1803–1807位,GC含量為51.1％,不同個體內(nèi)含子片段長度接近,但序列存在差異。表明18SrDNA協(xié)同進化存在差異。

4、而絲狀體不同品系間18SrDNA基因結(jié)構(gòu)多樣性較低,10個品系的18SrDNA均含有內(nèi)含子結(jié)構(gòu),一個品系內(nèi)含子丟失。不同品系的ITS1區(qū)域和ITS2區(qū)域序列變異程度差別較大,構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹呈現(xiàn)不同的拓撲結(jié)構(gòu)。純合絲狀體個體內(nèi)部ITS序列不同拷貝序列相似度為100%,表明協(xié)同進化程度較高。條斑紫菜ITS序列未呈現(xiàn)長度多態(tài)性,堿基序列存在不同程度變異。
　　本研究結(jié)果將為紫菜的種質(zhì)鑒定及遺傳多樣性分析提供理論支持,也將為了解紫菜屬物