中國荷斯坦奶牛主要產(chǎn)奶性狀候選基因研究.pdf

1、本研究應(yīng)用PCR-SSCP方法對北京郊區(qū)9個奶牛場758頭中國荷斯坦奶牛群體的催乳素(PRL)、信號傳導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄激活因子5a(signaltransducerandactivatoroftranscription5a，STAT5a)、核心家族特異性轉(zhuǎn)錄因子(nuclearfamilyofspecificTranscriptionFactor,NFIC)和G蛋白耦聯(lián)受體10(Gprotein-coupledreceptor10，GPR10)

2、基因進(jìn)行了基因型的鑒定，并對單個SNP及其二倍型與主要產(chǎn)奶性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析，得到以下主要結(jié)論： 1、根據(jù)已知的人、大鼠和小鼠GPR10基因和NFIC基因的保守序列，設(shè)計并合成特異性引物，得到奶牛GPR10基因和NFIC基因的cDNA片段，進(jìn)一步采用3’RACE和5’RACE方法，成功克隆了牛GPR10基因組全長和NFIC基因cDNA的全長序列。 2、在PRL基因的5’側(cè)翼區(qū)、和內(nèi)含子1內(nèi)發(fā)現(xiàn)了4個SNPs：-767(A

3、/C)，-485(T/G)，-247(A/C)和427(C/T)，分別命名為CHBP1、CHBP2、CHBP3和CHBP4。將4個SNPs位點與中國荷斯坦奶牛的5個產(chǎn)奶性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果表明；CHBP2位點對產(chǎn)奶量(p＜0.01)、乳脂量(P＜0.05)、乳蛋白量(P＜0.01)和乳蛋白率(p＜0.05)這4個主要產(chǎn)奶性狀的效應(yīng)達(dá)到顯著或極顯著影響。多重比較結(jié)果表明BB基因型的產(chǎn)奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘數(shù)極顯著或顯著高于AA

4、基因型(p＜0.01或p＜0.05)；AA基因型的乳蛋白率最小二乘均數(shù)顯著高于AB、BB基因型(p＜0.05)?；?個SNPs，構(gòu)建得到9種單倍型，共得到12種二倍型。關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明：二倍型H2H8對產(chǎn)奶性狀的效應(yīng)達(dá)到顯著水平：產(chǎn)奶量(p＜0.05)、乳脂量(p＜0.05)、乳蛋白量(p＜0.05)和乳脂率(p＜0.05)。 利用TFSEARCH(version1.3)軟件分析奶牛PRL基因5’側(cè)翼區(qū)的-485(T/G)突變

5、，發(fā)現(xiàn)該SNP增加了一個轉(zhuǎn)錄因子CdxA的結(jié)合位點。 3、采用肉牛STAT5a基因的SNP引物序列，檢測了中國荷斯坦奶牛STAT5a基因的多態(tài)性，共發(fā)現(xiàn)了7個SNPs：C6685T、G6716C、A9501G和CCT12550缺失或插入、T12440C、C12735T、T12765A(后4個突變位點緊密連鎖)，分別命名為Site1、Site2、Site3和Site4。外顯子16的12735位堿基處T→C突變導(dǎo)致氨基酸發(fā)生改變：Y

6、680H，其余突變發(fā)生在內(nèi)含子里。 關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明：Site2對乳脂量和乳脂率的效應(yīng)都達(dá)到顯著水平(p＜0.05)，BB基因型個體的乳脂率最小二乘均數(shù)顯著大于AB、AA基因型個體(p＜0.05)；Site4位點對產(chǎn)奶量的效應(yīng)達(dá)到極顯著水平(p＜0.01)，對乳脂量和乳蛋白量的效應(yīng)均達(dá)到顯著水平(p＜0.05)，AB基因型個體的產(chǎn)奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均數(shù)顯著高于AA基因型(P＜0.05)。7個SNPs構(gòu)建得到9種主要