中國(guó)地方家鴨品種的分子遺傳多樣性研究.pdf

1、為全面了解中國(guó)家鴨遺傳資源的現(xiàn)狀、遺傳多樣性及遺傳關(guān)系，本研究通過(guò)原產(chǎn)地調(diào)查并采集了來(lái)自中國(guó)不同地區(qū)的24個(gè)地方鴨種，通過(guò)微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)，檢測(cè)了24個(gè)中國(guó)地方鴨種1440個(gè)個(gè)體在28個(gè)微衛(wèi)星基因座的基因型。分析了等位基因頻率、群體雜合度(H)、有效等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量、群體間的Nei氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離(DS)和DA遺傳距離，采用鄰近結(jié)合法、主成分分析和群體遺傳結(jié)構(gòu)分析等方法，對(duì)24個(gè)中國(guó)地方鴨種的群體內(nèi)的遺傳變異進(jìn)行了分析。研究結(jié)果如下

2、： 1.原產(chǎn)地調(diào)查顯示，我國(guó)26個(gè)地方鴨品種中，文登黑鴨和中山麻鴨瀕臨滅絕，現(xiàn)存的24個(gè)地方鴨種中，建昌鴨和四川麻鴨處于危險(xiǎn)狀態(tài)，其他22個(gè)鴨品種均處于正常狀態(tài)。 2.進(jìn)行了血樣保存方法的比較，研究了乙醇保存家禽血樣的效果，結(jié)果表明，利用75％的乙醇按4：1的體積比處理家禽血樣，不僅操作簡(jiǎn)便快捷，常溫保存較長(zhǎng)的時(shí)間；而且，從該血樣中可以提取高質(zhì)量的DNA。 3.檢測(cè)了28個(gè)微衛(wèi)星座位在24個(gè)地方鴨種中的等位基因數(shù)

3、及多態(tài)信息含量。28個(gè)微衛(wèi)星座位總共檢測(cè)到236個(gè)等位基因，擁有的等位基因數(shù)量非常豐富(5-13)，平均值為8.428；檢測(cè)到134.4個(gè)有效等位基因，平均值為4.800。有效等位基因數(shù)小于實(shí)際觀察等位基因數(shù)。除座位APL23和APL79的PIC為中度多態(tài)外，其它座位的PIC均具有較高的多態(tài)性。平均期望雜合度為0.7613，顯示出豐富的遺傳多樣性和較高的選擇潛力。各座位的有效等位基因數(shù)、平均多態(tài)信息含量和期望雜合度三者呈正相關(guān)的關(guān)系。從

4、品種的角度看，貴州省的三穗鴨和興義鴨在28個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記中的平均等位基因數(shù)最高，皆為4.25，而平均等位基因數(shù)最低出現(xiàn)在福建省的連城白鴨，平均等位基因數(shù)只有3.36。 4.檢測(cè)了24個(gè)地方鴨品種在同一微衛(wèi)星座位上等位基因數(shù)目和頻率的差異。結(jié)果顯示：24個(gè)地方品種擁有27個(gè)特有等位基因以及數(shù)量相當(dāng)?shù)膬?yōu)勢(shì)等位基因，28個(gè)微衛(wèi)星基因座都有優(yōu)勢(shì)等位基因存在。24個(gè)品種中，三穗鴨的期望雜合度最高，0.6166；其次為微山麻鴨；雜合度最低的為

5、金定鴨，0.5137。24個(gè)鴨群體的平均雜合度為0.569，遺傳多樣性較低，選擇的潛力相對(duì)較小。 5.群體間的遺傳變異經(jīng)F統(tǒng)計(jì)量分析，單個(gè)座位偏離Hardy-Weinberg平衡的群體數(shù)從0到8不等。對(duì)于整個(gè)群體而言存在著極顯著的遺傳分化，群體間遺傳分化系數(shù)達(dá)到0.264(P<0.001)，并且所有座位都顯著地貢獻(xiàn)于這一結(jié)果(P<．001)；雜合子缺失的水平很低。24個(gè)鴨群體之間的Nei氏標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離DS和DA遺傳距離的結(jié)果一致

6、。金定鴨和山麻鴨的遺傳距離最近；四川麻鴨和漢中麻鴨的遺傳距離最遠(yuǎn)。Nm值變異范圍為從0.4620(四川麻鴨一漢中鴨)到1.3692(金定鴨一山麻鴨)。 6.利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記分析24個(gè)中國(guó)鴨種遺傳距離與地理距離的關(guān)聯(lián)性，對(duì)于特定的群體而言，遺傳距離與地理距離表現(xiàn)出相當(dāng)程度的關(guān)聯(lián)性，但24鴨個(gè)種間遺傳距離和地理距離回歸公式：FST/(1-FST)=0.1976736+0.00005781n(d)以及Mantel’s檢驗(yàn)的結(jié)果(p

7、=0.19192)并不能為兩者間的顯著聯(lián)系提供足夠的證據(jù)，表明在中國(guó)地方鴨品種的形成過(guò)程中，各自的地理分布可能并不是影響其群體遺傳結(jié)構(gòu)的決定因素。 7.利用28對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記基于DA遺傳距離對(duì)24個(gè)群體的親緣關(guān)系進(jìn)行分析，結(jié)合中國(guó)地方鴨種的歷史起源、地理位置、生態(tài)條件、特定性狀以及形態(tài)特征等，NJ聚類法將24個(gè)中國(guó)地方鴨種分為5大類：恩施麻鴨、荊江麻鴨、沔陽(yáng)麻鴨、建昌鴨、四川麻鴨、靖西大麻鴨和廣西小麻鴨聚為一類群；三穗鴨、興義鴨、

8、云南麻鴨、、連城白鴨、莆田黑鴨、金定鴨和山麻鴨聚為一類群；紹興鴨和高郵鴨聚為一類；巢湖鴨、漢中麻鴨和大余鴨聚類一類；攸縣麻鴨、臨武鴨、北鴨、微山麻鴨和淮南麻鴨聚為一類。 8.群體結(jié)構(gòu)分析表明24個(gè)地方鴨品種1440個(gè)個(gè)體的平均基因組分?jǐn)?shù)在所屬推斷類別中的平均基因組分?jǐn)?shù)都大于0.800，表明我國(guó)24個(gè)鴨群體各具有本品種的特征特性。 9.根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，提出對(duì)現(xiàn)有中國(guó)地方鴨種的保種措施：可采集組織和血樣，貯存DNA信息，分析評(píng)