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文檔簡介
1、小葉楊(Populus simonii Carr)是我國重要的鄉(xiāng)土林木資源，具有優(yōu)良的抗逆基因資源，但很少有人對影響這些抗逆性狀的分子遺傳學機制進行深入研究，因此，探明影響這些性狀的分子遺傳學基礎，尤其是分離控制它們的基因并對其進行核苷酸多樣性分析就顯得尤為必要。本論文以小葉楊為材料，分別對BREB1D基因、熱激轉錄因子基因進行了克隆、回收、純化、連接、轉化和測序。分析基因的序列，得到如下研究結果: 1.PsHSFB基因長度為2
2、884bp基因內(nèi)部含有完整的編碼閱讀框架，可編碼466個氨基酸殘基，所推導的蛋白質(zhì)序列與擬南芥和葡萄HSF蛋白的同源性分別為63％和78％。在此基礎上，組合利用MEGA3.1和DNASP4.0軟件對小葉楊16株基因型個體的HSFB序列進行了比對和分析，共檢測到107個SNPs位點，多態(tài)性頻率為1/27bp。其中常見SNPs為42個，而罕見SNPs為65個。在PsHSFB基因內(nèi)部發(fā)生的單核苷酸變異中，有71個屬于轉換，有36個屬于顛換。在
3、外顯子區(qū)域，共檢測到52個SNPs位點，其中有15個為同義突變，37個為錯義突變。 2.PsDREB1D基因長度為800bp，基因內(nèi)部含有完整的開放閱讀框，可以編碼長度為240個氨基酸殘基的蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)的Mw約為33kDa，等電點為4.85，并分析了該基因蛋白質(zhì)在16個物種中的系統(tǒng)進化關系，以及該基因內(nèi)部的單核苷酸多態(tài)性和連鎖不平衡關系。經(jīng)過分析，小葉楊DREB1D與毛果楊該基因的序列同源關系最近。小葉楊該基因的SNP頻率是0
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