新選優(yōu)良玉米自交系遺傳多樣性分析及其指紋圖譜構(gòu)建.pdf

1、本試驗(yàn)利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所經(jīng)三性(一致性，穩(wěn)定性，特異性)鑒定的新選優(yōu)良玉米自交系共59份材料進(jìn)行了遺傳多樣性研究，并對其中20份玉米骨干系(包括5個代表四大類群的自交系)進(jìn)行了DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建研究，主要結(jié)果如下： 1.篩選出了一批對59份新選自交系具有較高多態(tài)性的SSR引物；并篩選出了一套適用于構(gòu)建20個骨干自交系指紋圖譜的核心引物。 2.利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)研究了59個玉米自交系

2、的遺傳多樣性，篩選出的58對引物在供試材料中共檢測出681個等位基因，每對引物檢測到等位基因2～25個，平均為11.7個；每個位點(diǎn)的多態(tài)性信息量(PIC值)變幅為0.34～0.94，平均為0.83±0.107，平均PIC值較大；59個自交系的遺傳相似系數(shù)變化范圍在0.61～0.93之間，平均為0.73±0.032。 3.根據(jù)遺傳相似系數(shù)矩陣，將59個自交系大致聚成10類，它們分別為以Mol7，黃早四，丹340，掖478和5003

3、為代表的Lmncaster，唐四平頭，旅大紅骨，Reid，4大類群和6個其他類群，屬四大類群的材料占供試材料的78％；其中屬Lancaster群的自交系約占總數(shù)的12％，屬唐四平頭群的約占10％，屬旅大紅骨群的約占5％，屬改良Reid群所占的比例較大，約占51％，且在相似系數(shù)0.727處又可分為2個亞類，說明這部分材料親緣關(guān)系較近，但也有一定的遺傳差異，屬其他類群的約占22％。說明這些材料與其他材料之間遺傳差異較大。試驗(yàn)中針對部分己知自

4、交系，從系譜的親緣關(guān)系分析，其SSR聚類結(jié)果與系譜追蹤有較好的一致性。 4.從80對SSR引物中，篩選出在大部分材料中都僅擴(kuò)增出一條譜帶、多態(tài)性很強(qiáng)、重復(fù)性好且極易識別，能區(qū)分開所有的供試材料的引物篩選到17對，它們可用于構(gòu)建本實(shí)驗(yàn)的20個玉米自交系的指紋圖譜。這17對SSR引物在20個玉米自交系之間共檢測出73個等位基因變異，每對引物檢測出2～8個等位基因，平均為4.3個。 5.本實(shí)驗(yàn)篩選出了可作為構(gòu)建供試20個玉米自

5、交系指紋圖譜的核心引物9對，分別是phi080，phil23，umcl061，phil26，phi065，dupssrl3，phil02228，bnlg40，phi083。這9對引物中有些引物對對單個材料能擴(kuò)增出特征性譜帶，有些引物對兩個材料有特異的譜帶，如引物phi065對M017，黃早四都有特異的分子標(biāo)記；引物phi080對sAMl00l，黃早四都有特異的分子標(biāo)記。實(shí)驗(yàn)中篩選到了材料SAMl001，丹340，SCML103，Mol7

6、，441950，SCML202等6個材料的特異分子標(biāo)記，分別只需要一對特異的引物就可以將他們與其他自交系相區(qū)分；材料黃早四有兩對特異的引物phi080和phi065；其余材料可以這些引物組合來區(qū)分。 6．本實(shí)驗(yàn)對9對核心引物的重復(fù)性也作了驗(yàn)證，無論是調(diào)節(jié)反應(yīng)體系還是反應(yīng)程序，只能造成非特異的擴(kuò)增產(chǎn)物的變化，而特異性產(chǎn)物無論在帶型還是在膠板上的相對位置是不會改變的，表明SSR分子標(biāo)記有較好的穩(wěn)定性和重復(fù)性，也說明利用SSR分子標(biāo)記