貴州6個地方水牛群體的遺傳多樣性及親緣關(guān)系研究.pdf

1、根據(jù)聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)推薦以及從文獻中查找得到22對普通牛微衛(wèi)星引物，通過試驗篩選從中獲得能用于沼澤型水牛研究的11對引物(HEL13、BM1225、BM1818、BM2113、EHT11、ETH10、ETH225、CSSRM60、CSSM66、INRA026、ILSTS005)，用以對6個貴州地方水牛群體進行微衛(wèi)星多態(tài)性檢測，從分子水平上提供了貴州地方水牛遺傳多樣性及親緣關(guān)系的根據(jù)。得到主要結(jié)果如下： 1、通過篩選，得到

2、可用于沼澤型水牛進行微衛(wèi)星分析的11對引物，確定了其相應的PCR反應條件，并獲得貴州地方水牛核基因組的多態(tài)性擴增結(jié)果。 2、從6個貴州地方水牛群體的11個微衛(wèi)星座位上共檢測到72個等位基因，其中共享等位基因49個，非共享等位基因23。各等位基因頻率介于0.0094～0.5236。 3、6個群體在11個微衛(wèi)星座位上的多態(tài)座位百分比均達100％，其觀察雜合度、期望雜合度、Nei氏期望雜合度分別為0.9278±0.2113、0

3、.7979±0.0297、0.7967±0.0296，平均雜合度為0.7612±0.0313。 4、本研究得到的平均有效等位基因數(shù)為4.2±0.9513個，平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.7196±0.0417，為高度多態(tài)，說明貴州地方水牛遺傳多樣性十分豐富。 5、本研究得到的Nei氏標準遺傳距離介于0.0965～0.3080，群體間遺傳距離最遠的是畢節(jié)水牛與黔南水牛，最近的是黔東南水牛與黔南水牛。遺傳相似系數(shù)則介于0.

4、7346～0.9050。 6、根據(jù)逐步突變模型，假定水牛微衛(wèi)星平均每代突變率為4×10-3，水牛世代間隔為6年，計算出貴州地方水牛的遺傳分化時間在290年～925年。 7、綜合對比UPMGA法和NJ法，對貴州地方水牛的6個群體進行了聚類分析，并結(jié)合對貴州水牛的傳統(tǒng)劃分，提出了對貴州水牛按“三類型式”和“四類型式”共四種劃分法的劃分體系，而以劃分為“黔北水牛、黔中水牛、黔南水牛、畢節(jié)水?！币约皠澐譃椤扒彼?、黔中水牛、黔