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文檔簡介
1、2002年國際食品微生物標準化委員會(ICMSF)把阪崎腸桿菌列為“嚴重危害特定人群,危害生命或慢性實質(zhì)性后遺癥或長期影響”的一種致病菌。嬰兒配方奶粉是其最主要的傳播途徑,而且嬰兒配方奶粉中微量的阪崎腸桿菌污染(<3CFU/100g)也能導致感染的發(fā)生,因此檢測阪崎腸桿菌的方法是否靈敏、特異及快速至關重要。
目前對阪崎腸桿菌的檢測方法主要有FDA推薦的傳統(tǒng)檢測方法,免疫學方法和PCR方法。傳統(tǒng)檢測方法操作繁瑣,檢測時間長,
2、而且靈敏度較低;免疫學方法的特異性和靈敏度也不理想;PCR方法敏感、快速,但由于需要昂貴的儀器設備、繁瑣的電泳過程,而使其難以在基層普及和推廣。采用環(huán)介導等溫擴增(Loop-mediated isothermal amplification,簡稱LAMP)技術,檢測嬰兒配方奶粉中的阪崎腸桿菌,靈敏度高,特異性強,檢測方法簡便,耗時短而且檢測成本低,能夠在基層普及和推廣。
針對阪崎腸桿菌(ATCC29544)GenBank中
3、(基因號AY702093)16S-23S rRNA的保守序列,運用在線引物設計軟件(https://primerexplorer.jp/lamp3.0.0/index.html)設計LAMP引物。對反應時間、反應溫度、鎂離子濃度等擴增條件進行優(yōu)化,確定25 μL的 LAMP反應體系為:內(nèi)引物(FIP和BIP)各1.2 μM,外引物(F3和B3)各0.2 μM,環(huán)引物(LF和LB)各0.6 μM,2.5 mM dNTP,1.6 M甜菜堿,
4、4 mM MgSO4,10×Bst DNA聚合酶反應緩沖液,8U的Bst DNA聚合酶大片段,3 μL DNA模板和用滅菌雙蒸水補足體系。LAMP反應過程是首先在64℃水浴鍋中反應20min,然后將其放入80℃水浴鍋中,水浴10min終止反應,通過肉眼觀察有無白色焦磷酸鎂沉淀,即可判斷是否發(fā)生了LAMP反應。
為了比較LAMP檢測阪崎腸桿菌靈敏度和人工污染檢出限,以 PCR方法作對照。PCR反應的引物是改良LAMP的兩條外
5、引物(F3和B3)。結果表明,改良LAMP檢測阪崎腸桿菌的檢出限為0.101CFU/mL,人工污染阪崎腸桿菌的嬰兒配方奶粉的檢出限為1.100CFU/g。采用試劑盒提取DNA,從樣品處理到報告結果,耗時1h。對照PCR耗時3h,檢測阪崎腸桿菌的檢出限為101CFU/mL,人工污染阪崎腸桿菌的嬰兒配方奶粉的檢出限為1100CFU/g。改良LAMP的靈敏度是PCR的1000倍。
對普通LAMP和改良LAMP以及改良LAMP自身
6、加環(huán)引物和未加環(huán)引物進行了檢測阪崎腸桿菌純培養(yǎng)和人工污染檢出限的比較,結果表明,改良LAMP的靈敏度是普通LAMP和未加環(huán)引物改良LAMP的10倍。
初步研究了6種模板制備方法對LAMP檢測嬰兒配方奶粉中阪崎腸桿菌的影響。研究表明LAMP方法對制備模板DNA的要求不高。通過對實際樣品進行檢測,將本方法與行業(yè)標準SN/T1632.1-2005方法進行比較,確定LAMP方法敏感性為100%,特異性為98.15%,符合率為98.
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